Naruto Uzumaki ist ein frecher 12-Jähriger Junge aus dem Dorf Konohagakure. Dort stellt er oft Unsinn an und wird deswegen von seinem Lehrer Iruka immer wieder zurechtgewiesen, doch Naruto lernt nur selten aus seinen Fehlern. So hat er dieses Mal die Steinportraits der ehemaligen Hokage, ein Denkmal von Konoha, mit Schmierereien beschmutzt und muss nun zur Strafe noch einmal eine Technik wiederholen, welche im Unterricht behandelt wurde. Seine Aufgabe ist es, sich in Iruka zu verwandeln, jedoch verwandelt sich Naruto in ein hübsches, junges Mädchen und sorgt so bei seinem Lehrer für heftiges Nasenbluten und einen Wutanfall. Darauf muss Naruto seine Schmierereien wieder entfernen, Iruka lädt ihn jedoch aus Mitleid zu einer Nudelsuppe ein – Narutos Leibspeise!
Jedoch fällt Naruto bereits am nächsten Tag bei den Prüfungen an seiner Schule durch, die ihn endlich zu einem Genin, einem Ninja der Anfängerklasse, gemacht hätte. Da er schon zum dritten Mal durchfällt, meint Iruka, dass Naruto wohl ein hoffnungsloser Fall sei. Sein Kollege Mizuki ist da anderer Meinung und erzählt dem niedergeschlagenen Jungen, dass er die Prüfung sofort bestehen wird, wenn er es schafft, eine geheime Schriftrolle aus dem Büro des Hokage zu stehlen. Naruto schafft es auch, diese Schriftrolle zu stehlen und flüchtet in den Wald, wo er sofort damit beginnt, eine Technik aus der Rolle zu lernen. Im Dorf wird jedoch beschlossen, dass man Naruto nun nicht mehr verzeihen kann, da diese Tat die Tragweite eines Streichs weit überschreitet. So ziehen einige Ninja aus, um Naruto zu töten.
Iruka jedoch will Naruto noch eine Chance geben und sucht deswegen auch nach seinem Schüler, findet diesen auch schnell im Wald. Dort berichtet Naruto ihm stolz, dass er bereits eine der Techniken gelernt hat und nun doch sicher bestehen wird. Verwirrt sieht Iruka ihn an, wird dann jedoch von mehreren Kunai getroffen. Mizuki, der Naruto nur für seine Zwecke ausnutzen wollte, fordert nun die Schriftrolle, doch sowohl Iruka als auch Naruto weigern sich, sie ihm zu übergeben. Naruto schafft es sogar, den korrupten Lehrer dank seiner neu gelernten Technik zu besiegen. Iruka, welcher stolz darauf ist, dass Naruto so etwas geschafft hat, überreicht ihm sein Stirnband, was Naruto offiziell zu einem Genin werden lässt.
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Wenig später muss Naruto sich beim Hokage als Genin registrieren, jedoch hat er ein unmögliches Foto machen lassen und wird aufgefordert, ein anderes anzufertigen. Naruto ist empört, wird jedoch von Konohamaru, dem Enkel des dritten Hokage, unterbrochen. Dieser attackiert den Hokage, welcher seinen Angriff jedoch leicht abwehren kann. Ebisu, der Privatlehrer von Konohamaru, entschuldigt sich beim Hokage und tadelt seinen Schüler. Als Naruto erfährt, dass Konohamaru seinen Großvater nur besiegen will, damit er selbst Hokage werden kann, nimmt sich Naruto seiner an. Da er es mit seinem Oirioke no Jutsu geschafft hat, den Hokage, wenn auch nur für kurze Zeit, außer Gefecht zu setzen, möchte Konohamaru es auch lernen.
Nach einigen Versuchen schafft er es auch, doch dann greift Ebisu ein und befiehlt Konohamaru, dass er sich von solchem Abschaum, wie Naruto es sei, fernhalten solle. Konohamaru ist gar nicht begeistert und wendet seine neue Technik gleich bei seinem Lehrer an, welcher zwar von ihr sehr angetan ist, aber noch nicht umgehauen wird. Naruto lässt es sich nicht gefallen, als Abschaum bezeichnet zu werden, darum verbindet er seine selbst erfundene Technik und seine neue Technik, die Kagebunshin no Jutsu, miteinander und erschafft so dutzende Doppelgänger, die sich alle in schöne Frauen verwandeln und Ebisu bezirzen. Nachdem dieser in Ohnmacht gefallen ist, erklärt Naruto Konohamaru, dass er erst ihn besiegen müsse, wenn er Hokage werden will, und die beiden sehen sich von nun an als Rivalen.
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Kurz darauf werden alle Genin dieses Jahrgangs einem Jounin zugeteilt, welcher mit ihnen ein Team bilden soll. Naruto wird dem eingebildeten Sasuke Uchiha und der hübschen Sakura Haruno zugeteilt; alle drei sollen unter der Leitung des Jounin Kakashi Hatake das Team 7 bilden. Naruto jedoch hat keine Lust, mit Sasuke in einem Team zu sein, jedoch findet er Sakura sehr süß. So überwältigt er Sasuke und nimmt seine Rolle ein, um Sakura zu fragen, was sie von ihm und von Sasuke hält und wie sie über sie denkt. Jedoch wird er dabei von sehr unangenehmen Problemen mit seinem Darm gestört und im Endeffekt kann er nichts erreichen.
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Team 7 trifft sich nun das erste Mal. Kakashi erläutert seinen Schülern, dass sie sich vorstellen sollen, was allesamt auch tun; er selbst hüllt sich jedoch in Schweigen. Dann erklärt er ihnen, dass er sie noch einer kleinen Prüfung unterziehen möchte, bevor er sie wirklich als seine Schüler anerkennt und sie am nächsten Morgen zum Trainingsplatz kommen sollen. Am besagten Ort zu besagten Zeit erklärt ihnen Kakashi, der zu spät gekommen ist, dass sie ihm ein kleines Glöckchen abnehmen müssen, um zu bestehen, jedoch gibt es nur zwei Glückchen. Wer keine Glocke bekommt, wird zurück auf die Akademie geschickt. Alle drei können es nicht fassen und strengen sich unglaublich an, doch schafft es keiner, die Glöckchen in der festgelegten Zeit zu ergattern.
Naruto, der versucht hatte, das vorbereitete Essen zu stehlen, wird an einen Pfahl gebunden und Sasuke und Sakura sollten sich stärken. Doch Sasuke, nachdem er ein wenig gegessen hatte, überreicht Naruto seinen Rest, worauf Sakura ihn fütterte – Naruto war ja immer noch gefesselt -, weil Sasuke der Meinung war, dass sie als Team bessere Chancen hätten. In diesem Moment taucht Kakashi auf und erklärt ihnen, dass sie bestanden haben, weil es bei dieser Prüfung nicht darum ging, ob man wirklich eines der Glöckchen bekommen konnte, oder nicht, sondern dass man sich gegenseitig hilft und vertraut und als ein Team zusammenarbeitet.